Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
LtaP09225 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
LtaP09225 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms