Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P01658 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P01658 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P01658 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms