Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
CcnkO88874 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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