Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

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Length 1,416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BlmO88700 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BlmO88700 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BlmO88700 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BlmO88700 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms