Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cfdp1O88271 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cfdp1O88271 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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