Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp4O70480 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms