Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ptpn20O55082 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms