Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rdh16O54909 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms