Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Zmat3O54836 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Zmat3O54836 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms