Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DffaO54786 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
DffaO54786 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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