Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cnih1O35372 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cnih1O35372 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms