Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnk3O35111 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms