Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Hps1O08983 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms