Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MttpO08601 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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MttpO08601 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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MttpO08601 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
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MttpO08601 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
MttpO08601 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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