Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20795J3QP49 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Gm20795J3QP49 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Gm20795J3QP49 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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