Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Gm21900J3QP38 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm21900J3QP38 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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