Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm21060J3KMU4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms