Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Vmn1r67G5E8C1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms