Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Vmn1r58G3X9U3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms