Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScaperF8VQ70 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms