Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm8005F6YKY3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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