Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atad2bE9Q166 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atad2bE9Q166 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms