Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rdh8D3Z6W3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms