Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf217D3YYI7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf217D3YYI7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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