Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Kif28pD3YXS5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms