Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Phf11bB4XVQ1 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms