Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm6133B2RY53 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm6133B2RY53 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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