Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 356.1 ms