Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trabd2bB1ATG9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trabd2bB1ATG9 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Trabd2bB1ATG9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trabd2bB1ATG9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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