Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Tmem238A9JSM3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Tmem238A9JSM3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms