Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-M5A7VMS3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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