Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc183A2AJB1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc183A2AJB1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms