Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Cldn34dA2AGU5 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cldn34dA2AGU5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms