Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Prdm16A2A935 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms