Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Top3bQ9Z321 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Top3bQ9Z321 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms