Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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Hdac6Q9Z2V5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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