Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PapolbQ9WVP6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PapolbQ9WVP6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms