Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nme3Q9WV85 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nme3Q9WV85 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms