Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
TapbpQ9R233 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TapbpQ9R233 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TapbpQ9R233 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms