Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zeb2Q9R0G7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zeb2Q9R0G7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms