Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Vav3Q9R0C8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms