Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms