Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChmQ9QXG2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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