Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms