Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rabgef1Q9JM13 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms