Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Hmgn5Q9JL35 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hmgn5Q9JL35 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hmgn5Q9JL35 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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