Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ldb3Q9JKS4 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ldb3Q9JKS4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms