Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ybx3Q9JKB3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms