Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gfra4Q9JJT2 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms