Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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Rb1cc1Q9ESK9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rb1cc1Q9ESK9 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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